药物化学是2011年新增的本科专业，其研究任务包括：研究药物的化学结构和活性间的关系（构效关系）；药物化学结构与物理化学性质的关系；阐明药物与受体的相互作用；鉴定药物在体内吸收、转运、分布的情况及代谢产物；通过药物分子设计或对先导化合物的化学修饰获得新化学实体创制新药。
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主要实践教学环节
包括课程实习、毕业实习等等。
培养目标
本专业主要培养具有药学、管理学、经济学、法学等相关的知识和技能，能在药品部门及相关机构从事药物化学分析、药事与企业管理、策划以及教学、科研等方面的工作，探索药物化学事业科学发展规律的复合型高级人才
专业培养要求
通过本专业的学习，使学生能够熟悉化学药物的结构、理化性质、体内代谢及临床应用，为有效、合理地使用化学药物提供理论依据，为从事新药研究奠定理论基础。
毕业生具备的专业知识与能力
1.熟悉常用药物的结构，中英文通用名及化学名称；2.掌握典型药物的理化性质，特别是影响药效、毒性、质量控制及分析和剂型选择有关的理化性质；3.懂得新药设计和创制的基本原理和方法；4.掌握常用药物的作用机制、体内代谢、毒副反应（即临床应用），熟悉药物的结构特征与药效之间的关系，含各类重要药物的发现和发展过程、构效关系；5.熟悉化学药物的制备及结构修饰的原理和方法，懂得杂质与制备关系及如何控制杂质，保证药物质量的方法；6.熟悉各类药物发展及结构类型，了解其最新进展，能够对常用化学药物的合成原理和合成路线的设计及评价；7.了解新药研究的基本方法和近代新药发展方向。